Üretici firmaların ilgili derneklere ya da organizasyonlara başvuru yapmasının ardından dernek tarafından bir denetleme günü belirlenir ve bu gün firmaya bildirilir. Ayrıca, firmanın üretim sürecinde dikkat etmesi gereken bazı hususlar belirlenerek denetim gününe kadar bu hususların uygulanması gerektiği firmaya bildirilir. Buraya kadar bahsedilenler helal gıda ürünleri denetim aşamaları için bir başlangıç niteliğindedir.
Denetim günü geldiğinde tamamen tarafsız olan denetçiler firmaya gelir ve firma yetkilileriyle bir toplantı yapılarak üretim sürecindeki detaylı incelemenin nasıl yapılacağının planı çıkarılır ve bu plan doğrultusunda denetim hassas bir şekilde yapılır. Üretim sürecinin tümünün detaylı bir şekilde incelenmesiyle denetim günü sona erer. Denetçiler tarafından gün içinde belirlenen uygunsuzluklar ve düzeltilmesi gerekenler gün sonunda bir toplantıyla firma yetkililerine bir rapor halinde detaylı bir şekilde sunulur. Ayrıca, bu uygunsuzlukların nasıl giderileceği ile ilgili detaylar firma yetkililerine en ince ayrıntısına kadar açıklanarak uygunsuzluğun giderilmesi için adım atılmış olur.
Belirlenen uygunsuzlukların firma tarafından düzeltilmiş olduğunu raporlama görevi ise yine denetçilerindir. Eğer uygunsuzlukların giderildiği raporlanırsa firma helal gıda sertifikası lamaya hak kazanır. Bu sertifikanın geçerlilik süresi 1 yıl olup 1 yıl dolduğunda sözleşmenin tekrar yenilenmesi gerekir. Sözleşme yenileme aşamasında da helal gıda ürünleri denetim aşamaları detaylı bir şekilde uygulanarak sertifika tekrar verilmeden önce firmanın ürünlerinin gerçekten helal olduğu ispatlanır.